Для укрепления служебной дисциплины, борьбы с коррупцией в рядах фискального органа действует подразделение по служебным расследованиям. Данное подразделение рассматривает заявления граждан о вымогательстве, даче взяток, злоупотреблении и превышении служебных полномочий работниками Департамента государственных доходов.
По итогам за три квартала текущего года, было проведено более десятка служебных расследований и проверок по жалобам граждан о нарушении их прав. В результате проведенной работы, в трёх случаях действия сотрудников признаны неправомерными. Различные наказания понесли 88 сотрудников, более 3 человек освобождены от занимаемых должностей, возбуждено 1 уголовное дело по факту экономической контрабанды, также проводится досудебное расследование областным Департаментом Агентства Республики Казахстан по противодействию коррупции (Антикоррупционная служба).
Необходимо отметить, что информация о правонарушениях государственных служащих в основном поступает от самих граждан и выявленных в ходе внутреннего анализа коррупционных рисков.