Проект создания в Казахстане Академии военной медицины подготовило Главное военно-медицинское управление Вооруженных сил РК. В рамках проекта предусматривается реорганизация имеющихся сегодня учреждений по подготовке военных медиков, проведение оргштатных мероприятий, создание необходимой инфраструктуры, учебно-материальной базы академии, разработка образовательных программ и получение лицензии.
По данным Министерства обороны, сейчас в Казахстане военные врачи получают образование на базе Военного института Сил воздушной обороны совместно с Западно-Казахстанским медицинским университетом им. Марата Оспанова в Актобе. Подготовка военно-медицинских кадров по программе послевузовского медицинского образования осуществляется на базе кафедры военной медицины Национального университета обороны РК в рамках академической мобильности с Медицинским университетом «Астана».
Кроме того, казахстанцы учатся по программам высшего и послевузовского медицинского образования в России, Узбекистане, Армении, Китае и Турции. Однако, как отмечают в министерстве, получение военного медицинского образования за рубежом сопряжено с наличием языкового барьера, национальных и культурных различий, а также с особенностями процедур признания диплома.