13 мая 2020 года приговором суда №2 района «Байконыр» столицы к 6 годам лишения свободы. С пожизненным лишением права занимать должности на государственной службе осужден Айнабеков.
Он подозревался в злоупотреблении должностными полномочиями, путем необоснованного заключения дополнительных соглашении с ИП «Оразалиев» по проведению в 2017 году химической обработки саранчовых вредителей в Жамбылской области, повлекшее тяжкие последствия.
Также он подозревался в превышении должностных полномочий выразившихся в требовании 4 000 литров ядохимиката у ТОО «КазТрастКем» на безвозмездной основе и незаконном привлечении специальной техники подведомственной Комитету организации на места обработки.
Действиями Айнабекова государству и юридическим лицам нанесен ущерб на сумму более 48 млн тенге.